水溶性两性高分子聚丙烯酰胺在水处理方面已具有较广泛的应用，如用作絮凝剂、污泥脱水混凝剂和金属离子吸附剂等。与仅含有一种电荷的水溶性阴离子或阳离子的聚丙烯酰胺相比，它具有自身的特点。
一、絮凝剂
两性高分子聚丙烯酰胺用作絮凝剂不仅可除去废水中的悬浮物和胶体，而且可除去一般絮凝剂所不及的范围---废水中的溶解物。这是因为两性高分子中的阴、阳离子基团能与色度物质、腐殖酸类物质及表面活性剂等物质发生络合作用，再通过絮凝沉淀达到去除的目的。因此可望在印染废水处理、微污染给水处理等方面起到积极的作用。
二、污泥脱水混凝剂
两性高分子聚丙烯酰胺兼有阴、阳离子基团的特点，不仅具有电中和、吸附架桥作用，而且还有分子间的“缠绕”包裹作用，所以具有较好的脱水性能。它对不同性质、不同腐败程度的污泥都具有较好的脱水、助滤作用，得到的泥饼含水率低，且用量较少，所以称为国内外的研究热点。
三、金属离子吸附剂
由于两性高分子聚丙烯酰胺内阴、阳离子基团能与金属离子发生螯合作用，而在等电点时又可将其释放出来。利用此性质可将金属离子分离回收，这对重金属污染的治理将起到积极的作用。
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